تناولت توجّهات وتوصيات المؤتمر عديد الموضوعات من أهمها، اقتراح تشكيل اللجنة التأسيسية لدراسة إنشاء مؤسّسة عربية لضمان الجودة والاعتماد في التعليم العالي. واقتراح إنشاء شبكة عربية للتنسيق بين هيئات الاعتماد الوطنية، وحثّ من ليس لديه من الدول على إنشاء هيئاتها الوطنية للاعتماد، وإيلاء اللغة العربية الاهتمام اللاّزم مع عدم إهمال اللغات الأخرى، وقيام المنظّمة بدراسة هذا الأمر بعناية ووضع برنامج عملي في هذا الإطار. وضع آليات لاختيار القيادات العليا للجامعات ومؤسسات التعليم العالي بما يحقق مبدأ التنافسية. الدعوة إلى وضع استراتيجية متكاملة لتنمية التميز والإبداع لدى طلبة التعليم العام كمدخل للتعليم العالي. والدعوة إلى تحقيق التكامل بين التعليم العام والتعليم العالي في المناهج التعليمية. وتشجيع البحوث المشتركة التي تتناول القضايا العربية ذات الاهتمام المشترك في مجال التعليم العالي والبحث العلمي. دعوة الحكومات العربية إلى مراجعة أنظمة الخدمة (التقاعد) لأعضاء هيئة التدريس بمؤسّسات التعليم العالي بما يحقق الاستفادة القصوى من معارفهم وخبراتهم المتراكمة التي حصلوا عليها. ودعوة الدول العربية إلى التوسع في ربط الجامعات والمؤسسات البحثية العربية إلكترونيا، وتحقيق التواصل الفعال لها مع مثيلاتها، على المستويين الإقليمي والعالمي. وتعزيز كفايات أعضاء هيئة التدريس في الجامعات ومؤسسات التعليم العالي بالتنمية المهنية المستدامة.